Lai palielinātu vai samazinātu teksta burtu izmēru, izmantojiet šādas klaviatūras taustiņu kombinācijas: 
WGS-NMRL-Latvia
EUROPEAN HEALTH AND DIGITAL EXECUTIVE AGENCY (HaDEA) EU4Health Programme (EU4H) GRANTS Nacionālajai Mikrobioloģijas References Laboratorijai
Rīgas Austrumu klīniskās universitātes slimnīcas Laboratorijas dienestam ir valsts piešķirts status “Nacionālā mikrobioloģijas references laboratorija”, kurā īstenos projektu “Pilna genoma sekvencēšanas (WGS) un/vai reversās transkripcijas – polimerāzes ķēdes reakcijas (RT-PCR) testēšanas infrastruktūras un kapacitātes stiprināšanai, lai nodrošinātu nacionālās spējas reaģēt uz COVID-19 un citiem nākotnes apdraudējumiem.” ((Enhancing whole genome sequencing (WGS) and/or reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) national infrastructures and capacities to respond to the COVID19 pandemic and future health threats (CP-g-22-01.04) (EU4H-2022-DGA-MS-IBA-1))
Apakštēma: EU4H-2022-DGA-MS-IBA-01-02 — WGS un RT-PCR pasākumu konsolidācija valstīs, kuras saņēma atbalstu 2021. gadā, lai nodrošinātu uzlabotās infrastruktūras ilgtspējīgu izmantošanu un integrāciju ikdienas uzraudzības un uzliesmojumu izmeklēšanas pasākumos, sinerģijā ar
Projekta mērķis
Projekta galvenais mērķis ir nodrošināt ilgtspējīgu un efektīvu bīstamu mikroorganismu pilnu genomu sekvencēšanas (WGS) un reālā laika polimerāzes ķēdes reakcijas (RT-PCR) infrastruktūras izmantošanu Latvijā. Tas veicina infekciju uzlabotu uzraudzību, ātru slimību uzliesmojumu identificēšanu un sabiedrības veselības sagatavotību nākotnes pandēmijām.
Projekta apraksts
Šis projekts tiek īstenots Eiropas Savienības programmas *EU4Health* ietvaros un turpina iepriekšējo iniciatīvu, kas tika uzsākta Covid-19 pandēmijas laikā. Projekts koncentrējas uz:
- Genoma sekvencēšanas kapacitātes paplašināšanu epidemioloģiski nozīmīgām mikroorganismiem.
- Datu analīzes un vizualizācijas rīku ieviešanu, lai nodrošinātu ātru un precīzu informācijas apmaiņu ar Slimību profilakses un kontroles centru (SPKC), Nacionālo veselības dienestu un citām iesaistītajām pusēm.
- Sabiedrības informēšanu par epidemioloģiskajiem draudiem caur mājaslapu un sociālajiem medijiem.
Galvenās aktivitātes
- Tehnoloģiskie risinājumi: Bioinformātikas rīku ieviešana genoma datu analīzei.
- Datu pārvaldība: Sekvencēšanas datu apstrādes sistēmu izstrāde un integrācija.
- Apmācības: Laboratorijas speciālistu apmācība, lai nodrošinātu gatavību krīzes situācijām.
- Reaģentu iepirkums: Nepārtrauktai laboratorijas darbībai nepieciešamo reaģentu nodrošināšana.
- Sabiedrisko attiecību aktivitātes: Mājaslapas sadaļas izveide Nacionālajai atsauces laboratorijai ar regulāru informācijas atjauninājumu.
Projekta galvenie uzdevumi:
- Izveidot nacionālo informācijas sistēmu genotipēšanas datu ziņošanai visiem sabiedrības līmeņiem, integrējot epidemioloģiskās analīzes rīkus ar biznesa inteliģences risinājumiem.
- Nodrošināt jauniegūtās sekvencēšanas infrastruktūras ilgtspēju un garantēt epidemioloģisko gatavību, atbalstot aprīkojuma uzturēšanu un reaģentu iegādi mikroorganismu sekvencēšanai.
- Paplašināt sekvencēšanas pakalpojumu spektru, iekļaujot epidemioloģiski nozīmīgus mikroorganismus.
- Turpināt laboratorijas speciālistu apmācības, lai nodrošinātu gatavību un reaģētspēju krīzes situācijās.
- Izveidot Nacionālās references laboratorijas sadaļu mājaslapā un regulāri atjaunināt informāciju.
Sagaidāmie rezultāti
- Uzlabota epidemioloģisko draudu agrīna identificēšana.
- Ātra reakcija uz infekcijas slimību uzliesmojumiem gan nacionālā, gan ES līmenī.
- Sabiedrības veselības budžeta efektīvāka plānošana, balstoties uz precīziem epidemioloģiskiem datiem.
Finansējums
Projekta kopējais finansējums ir 1 229 858 eiro, tostarp Eiropas Savienības līdzfinansējums 962 485 eiro
Projekta brošūra LV
Projekta brošūra ENG
Austrumu slimnīca stiprina Latvijas spēju precīzāk atklāt infekciju uzliesmojumus un sagatavoties nākotnes veselības apdraudējumiem
Rīgas Austrumu klīniskajā universitātes slimnīcā (Austrumu slimnīca) 2026. gada 30. jūnijā noslēdzas Eiropas Savienības programmas “EU4Health” līdzfinansētais projekts, kura laikā trīs gadu garumā stiprinātas Nacionālās mikrobioloģijas references laboratorijas iespējas uzraudzīt infekciju izplatību, precīzāk identificēt uzliesmojumus un labāk sagatavoties nākotnes sabiedrības veselības apdraudējumiem.
Attēlā: klīniskās izdalīšanas iekārta
Projekta laikā pilnveidota laboratorijas infrastruktūra paraugu sagatavošanas, sekvencēšanas un datu analīzes posmos, stiprinot laboratorijas kapacitāti pilna genoma sekvencēšanas un genomiskās epidemioloģijas jomā. Iegādātas jaunas sekvencēšanas iekārtas, kas dod iespēju analizēt sarežģītākus gadījumus un gūt detalizētāku informāciju par patogēniem. Vienlaikus palielināta primāro paraugu priekšapstrādes caurplūde un samazināta kritisko procesu atkarība no atsevišķām iekārtām, ieviešot vairākus robotizētas paraugu apstrādes protokolus, nodrošinot papildu nukleīnskābju ekstrakcijas platformu, centrifūgu, homogenizatoru un citas laboratorijas palīgiekārtas.
Attēlā: Laboratorijas Latvijas Infektoloģijas centrs vadītāja pienākumu izpildītājs Gatis Pakarna
Būtiski papildināta arī Austrumu slimnīcas datu centra infrastruktūra, attīstot gan datu glabāšanas, gan lielapjoma skaitļošanas iespējas. Tādējādi samazināta nepieciešamība pārvietot datus uz ārējiem resursiem, radīta iespēja efektīvāk lokāli analizēt sekvencēšanas datus un nodrošināt to pieejamību ilgtermiņā.
Attēlā: sekvenators
Šie uzlabojumi stiprina laboratorijas gatavību reaģēt uz palielinātu paraugu plūsmu arī iespējamo nākotnes epidemioloģisko krīžu gadījumā. Pilna genoma sekvencēšana ļauj ar augstu izšķirtspēju identificēt infekciju avotus, uzraudzīt patogēnu izplatību un izvērtēt, vai dažādi infekcijas gadījumi ir savstarpēji saistīti, kas ir īpaši būtiski uzliesmojumu izmeklēšanā. Attīstītā infrastruktūra palīdz analizēt gan veselības aprūpes iestādēs nozīmīgus patogēnus ar antimikrobo rezistenci, gan pārtikas izcelsmes patogēnus, stiprinot laboratorijas iespējas piedalīties infekciju uzraudzībā nacionālā un starptautiskā līmenī.
“Nacionālās mikrobioloģijas references laboratorijas attīstībai ir būtiska nozīme Latvijas sabiedrības veselības sistēmā. Šāda kapacitāte palīdz savlaicīgi pamanīt riskus, nodrošināt kvalitatīvu informāciju atbildīgajām institūcijām un stiprināt sadarbību starp laboratorijām, epidemiologiem un ārstniecības iestādēm. Mūsdienīga infekciju uzraudzība ir viens no priekšnoteikumiem, lai valsts spētu pamatoti un ātri reaģēt situācijās, kas var ietekmēt sabiedrības veselību,” skaidro Austrumu slimnīcas valdes priekšsēdētājs Vadims Beļuns.
Attēlā: centrifūga
Austrumu slimnīcas Nacionālā mikrobioloģijas references laboratorija savā darbā aptver visus Latvijas statistiskos reģionus un nodrošina būtisku valsts mēroga funkciju mikrobioloģiskajā diagnostikā, infekciju uzraudzībā un sabiedrības veselības drošības stiprināšanā. Projekta laikā stiprināta sadarbība ar Slimību profilakses un kontroles centru, Pārtikas drošības, dzīvnieku veselības un vides zinātnisko institūtu BIOR, Lietuvas Nacionālo sabiedrības veselības laboratoriju un Igaunijas Veselības pārvaldes Infekcijas slimību laboratoriju. Tāpat noris sadarbība ar Eiropas Savienības references laboratoriju antimikrobās rezistences jomā Dānijas Tehniskajā universitātē, kā arī regulāra datu apmaiņa ar Eiropas Slimību profilakses un kontroles centru.
Attēlā: vecākais laboratorijas bioinformātiķis Reinis Vangravs
Šāda sadarbība ir būtiska, jo infekciju uzraudzība un uzliesmojumu izmeklēšana prasa ātru informācijas apmaiņu starp laboratorijām, epidemiologiem, ārstniecības iestādēm un starptautiskajiem partneriem. Projektā attīstītā infrastruktūra un datu apstrādes risinājumi palīdz stiprināt Latvijas mikrobioloģijas laboratoriju tīkla iesaisti kopējā Eiropas infekciju uzraudzības sistēmā.
Projekts “Consolidation and sustainability of WGS and RT PCR after HERA support received in 2022 to ensure the integration of enhanced infrastructure into routine surveillance and outbreak investigation” tiek īstenots Eiropas Savienības programmas “EU4Health” ietvaros. Projekta kopējais finansējums ir 1 229 858 eiro, tostarp Eiropas Savienības līdzfinansējums 962 485 eiro.
Projektu finansē Eiropas Savienība. Tomēr paustie viedokļi un uzskati ir tikai autora(-u) viedokļi un ne vienmēr atspoguļo Eiropas Savienības vai Eiropas Veselības un digitālās jomas izpildaģentūras (HaDEA) viedokli. Ne Eiropas Savienība, ne piešķīrēja iestāde nevar tikt saukta pie atbildības par tiem.
